Gra Sonic Mania Plus ma główne trio postaci: Sonic the Hedgehog, Miles „Tails” Prower oraz Knuckles the Echidna. Każdy z nich posiada te same podstawowe bitewne i ruchowe zdolności, szczycą się także swoimi umiejętnościami specjalnymi: zwinność Sonica pozwala mu na potężne przeturlanie się po skoku, Tails potrafi latać i pływa szybciej niż ktokolwiek inny, a Knuckles szybuje i wspina się na ściany.

W edycji Plus zostały dodane dwie nowe postaci, Mighty the Armadillo i Ray the Flying Squirrel. Dla niewtajemniczonych Mighty i Ray to postaci, które po raz pierwszy pojawiły się w grze na automaty SegaSonic the Hedgehog, a później powróciły w tytule na platformę Sega 32X, Knuckles’ Chaotix. Umiejętności specjalne Mighty'ego uwzględniają uderzenie w ziemię i turlanie się po pułapkach z kolcami, a Ray dysponuje zaawansowanymi zdolnościami latania pozwalające mu na dłuższy czas w powietrzu.