Anomaliler; adanın dört bir yanına dağılmış gizemli, doğaüstü olaylardır.

Oyuncular adayı keşfederek ve radyo ile belirli frekanslara bağlanarak anomalileri bulabilir. Radyonun frekansı doğru şekilde ayarlandığında bir anomalinin varlığına işaret eden tuhaf sesler ya da mesajlar ortaya çıkar. 

Anomalileri toplamak isteğe bağlıdır fakat toplamanın oyuncuya faydası olacaktır. Anomaliler, bazı durumlarda kaç tane keşfedildiğine bağlı olarak oyunun sonunu belli bir ölçüde etkileyebilir.